Klosteret blev grundlagt af ursulinernonner fra Erfurt i 1700 for at fremme en ordentlig opdragelse og uddannelse af unge piger.
En del af klosteret er Vor Frue Kirke. Det er ikke noget nyt, at den er blevet redesignet og ombygget. Den har undergået mange forandringer i sin mere end 500 år lange historie. Der var et lille Vor Frue-kapel i Duderstadt allerede i 1442, og da ursulinerne grundlagde deres kloster i Neutor i 1700, blev det lille gotiske kapel udvidet med et skib med søstrenes kor. I 1889/1890 blev denne kirke erstattet af en nyromansk bygning tegnet af R. Herzig i historicistisk stil. Alteret blev placeret på et plateau, der var hævet med 14 trin, og der blev tilføjet et sideskib. Søstrene fik et rummeligt kor overfor alteret. I 1963/64 fik kirkens indre et helt nyt design i overensstemmelse med retningslinjerne fra Det Andet Vatikankoncil og den daværende tendens til enkelhed. De nyromanske farver forsvandt under et lag hvid maling. Kirken fremstod lys og klar og gav frit udsyn til det væsentlige - alteret og korset fra 1500, som var blevet bragt tilbage i kirken.
Efter nødvendige renoveringer blev kirken indviet af biskop Norbert Trelle den 8. maj 2007. Det nye alter består af en enkel blok, mens mensaen (alterpladen) hviler på fire søjler. Det står i midten af skibet og er dermed placeret midt mellem de hesteskoformede bænke. En skinnende guldhjulslysekrone over alteret understreger dette steds betydning. Den korresponderer med cirklen af blå kunststen på gulvet. Alle vigtige steder i denne kirke er markeret med en sådan cirkel, også amboen og det lille kreditivbord. De tre borde er forbundet med et mørkerødt stenbånd i gulvet, der går ud fra apsis. Tabernaklet og en statue af Jomfru Maria står i sideskibet. Halvcirklen på ydervæggen i apsis er blevet suppleret med en cirkel af blå sten på gulvet. Her står det gamle kors med Maria og Johannes fra det tidligere Vor Frue Kapel. Figurfrisen på skibets vægge forestiller mennesker fra vores tid. De er alle orienteret mod fronten, mod apsis, og ser ud til at være mere eller mindre på vej derhen.